University of Maryland Forscher Details 2010 haitianischen Cholera

Eine neue Studie von einem internationalen Team von Wissenschaftlern unter Leitung von Forschern des Instituts für Genome Sciences (IGS) an der University of Maryland School of Medicine, dem Zentrum für Bioinformatik und Computational Biology an der University of Maryland, College Park, und CosmosIDTM Inc. geführt , College Park, haben zwei verschiedene Stämme gefunden Cholera Bakterien können mit dem 2010 in Haiti Cholera-Ausbruch beigetragen haben. Das Team veröffentlichte seine Ergebnisse 18. Juni 2012 in der Proceedings of the National Academy of Sciences(PNAS ) .

Die Forscher sagen, dass die Ergebnisse ihrer Studie, die die größte Zahl von Isolaten sequenziert und studierte von einem einzigen Ausbruch der Cholera beteiligt sind, zeigen die kritische Notwendigkeit für eine up -to-date , öffentliche genomischen Datenbank der Stämme Vibrio choleraeBakterien, die Ausbrüche der Krankheit auf der ganzen Welt führen. Eine solche Datenbank könnte eine wichtige Rolle bei den Bemühungen um zu verhindern oder reagieren auf Cholera-Ausbrüchen spielen , sagen Wissenschaftler in einem Team von Claire Fraser , Ph.D., einem internationalen Marktführer im Bereich der Genomik und Direktor des Instituts für Genomwissenschaften an der Co-Leitung University of Maryland School of Medicine, und Rita R. Colwell , Ph.D., ein international anerkannter Experte in Cholera und Distinguished Universitätsprofessor am Zentrum für Bioinformatik und Computational Biology , University of Maryland , College Park .

" Die vollständige Sequenzierung und phylogenomic Analyse mehrerer Isolate aus einer Infektionskrankheit Ausbruch hat gezeigt, dass es erhebliche genomischer Diversität unter den Cholera-Bakterien ", sagt Dr. Fraser . "Die Ergebnisse der Studie sprechen auf eine kritische Notwendigkeit für eine up -to-date , kuratiert und öffentlich zugänglichen Referenzgenomdatenbankmit den Spezies weltweit phylogenetischen Vielfalt.

Dr. Colwell betont, dass " angesichts der Vielfalt, die wir gefunden haben, eine solche Datenbank wäre Untersuchungen zukünftiger Cholera-Epidemien zu profitieren und eine genauere Risikobewertung für die Reaktion des Gesundheitswesens . "

Das Team bestand aus akademischen, Regierungs- und Industrie Wissenschaftler . Das Projekt wurde durch die University of Maryland School of Medicine Institute for Genome Sciences Genome Sequencing Center for Infectious Disease Auftrag aus dem Nationalen Institut für Allergie und Infektionskrankheiten , Teil der National Institutes of Health und ein Heimatschutzministerium Vertrag mit CosmosID , Inc.

Die Speerspitze der Arbeit zusammen mit Dr. Fraser und Dr. Colwell wurden Markus Eppinger , Ph.D., wissenschaftlicher Mitarbeiter am Institut für Genome Sciences , Nur Hasan , Thomas Cebula , Ph.D., bei CosmosIDTM Inc., und Jacques Ravel , Ph.D., Associate Professor an der University of Maryland School of Medicine und Associate Director für Genomik am Institut für Genome Sciences und Seon Young Choi , Ph.D., und Huai Li , Ph.D., bei CosmosIDTM Inc . , und der University of Maryland, College Park . Groß angelegte Sequenzierung -Technologie wurde verwendet, um die genomische Vielfalt der haitianischen Isolate von Cholera und die einzigartigen mikroevolutionäre Aspekte der haitianischen Cholera-Ausbruch , die im Jahr 2010 begann, zu studieren.

Cholera ist eine Krankheit endemisch in den Entwicklungsländern und den Erreger , V. cholerae, Ist natürlich in Flussmündungen und Flusssystemen auftretenden weltweit. Die 2010 Ausbruch der Cholera in Haiti erzeugt internationale Interesse wegen ihrer Intensität und plötzliche Auftreten im ganzen Land. In dieser Studie wurde die genomische Vielfalt der haitianischen Isolate auf einem genomweiten Maßstab untersucht, um die Komplexität der Arten und die Beziehung von Isolaten aus Haiti zu bestimmen, die von gleichzeitigen und letzten Cholera-Epidemien in der übrigen Welt isoliert .

"Dieses Projekt ist ein Beispiel für die Art von interdisziplinäre , kollaborative akademische Beziehungen , die unsere herausragende Wissenschaftler mit denen in unserem Schwester- Campus in College Park ", sagt E. Albert Reece , MD, Ph.D. , MBA , Vice President für medizinische Angelegenheiten an der Universität von Maryland und der John Z. und Akiko K. Bowers Distinguished Professor und Dekan an der University of Maryland School of Medicine. " Wir hoffen, dass mehr ähnlich bahnbrechende wissenschaftliche Erkenntnisse aus der Zusammenarbeit zwischen den beiden Schulen in vielen Bereichen der Wissenschaft und Medizin ergeben . "

Jayanth Banavar , Ph.D., Dekan der Hochschule für Informatik , Mathematik und Naturwissenschaften ( CMNS ) , betont " University of Maryland , College Park, die herrlichen Zusammenarbeit zwischen den wissenschaftlichen Teams der beiden Campus der University of Maryland und CosmosID , Inc. , diesen wichtigen Beitrag der öffentlichen Gesundheit zu erreichen. "