Auswertung der nächsten Generation Sequenzierung ( NGS) Daten und die damit verbundenen klinischen Aufzeichnungen von Kopf und Hals Plattenepithelkarzinom ( HNSCC ) Patienten aus verschiedenen Institutionen , die Bestandteil von Cancer Genome Atlas ( TCGA ) machte , zeigte, dass die Kombination von Mutant - Allele Tumor Heterogenität ( MATH ) als Biomarker mit dem Patienten HPV Status bietet eine effektive Indikator für verbesserte Behandlungsergebnisse , entsprechend der Forschung an der 2014 Multidisziplinäre Head and Neck Cancer Symposium vorgestellt.
Die TCGA Daten für HNSCC Patienten zur Verfügung inklusive 302 Patienten , mit 35 HPV -positiven Patienten . Die Forscher " Prüfung bestätigt, dass hohe Tumor MATH zum Zeitpunkt der Operation ist ein Indikator für die schlechte Prognose (high -MATH Hazard Ratio (HR) = 2,1 ; 95 Prozent Konfidenzintervall (CI) , 1,4 bis 3,2 ; p = 0,0002 , Log-Rang -Test) und dass HPV-positiven HNSCC Patienten niedrigere DurchschnittswerteMATH als HPV -negative HNSCC Patienten. In bivariaten Analyse wurden sowohl MATH und HPV signifikant mit dem Überleben verbunden. Wenn durch die HPV- Status stratifiziert , MATH wurde ähnlich wie in Ergebnis in klinisch definierten Untergruppen von Patienten , unabhängig von klinischen Merkmale ( Tumorränder , Knoten Klassifizierung oder Tumor-Staging ) bezogen . Medianen Follow-up mit den 173 überlebenden Patienten betrug 22 Monate.
Ein Tumor kann viele verschiedene Arten von Krebszellen enthalten . Standard-DNA- Sequenzierung entdeckt sowohl die DNA -Mutationen, die zwischen den Krebszellen unterscheiden und gibt ein Maß der Vielfalt. Genetische Heterogenität jedes Tumors wurde durch MATH , das prozentuale Verhältnis der Breite zur Mitte der Verteilung von tumorspezifischen Mutanten -Allel Fraktionen beurteilt. Um zu früheren Studien zu vergleichen, wurde die Analyse beschränkt auf mutante Allel Fraktionen nicht weniger als 0,075 , und die Hoch MATH Cutoff -Wert von 32 , die zuvor festgestellt Ergebnis Klassen zu unterscheiden, wurde verwendet . Cox- Analyse wurde verwendet, um die Beziehungen zwischen Mathematik und HPV auf das Gesamtüberleben zu bewerten.
"Berechnung der Patienten MATH Marker sowie deren HPV-Status ist ein zuverlässiger Indikator für das Überleben des Patienten , und die Methode , die wir messen MATH ist einfach genug , dass es ohne weiteres in der Klinik übernommen werden verwendet ", sagte Autor James Rocco , MD , PhD, ein Kopf-Hals- chirurgische Onkologe am Massachusetts General Hospital und Massachusetts Eye and Ear Infirmary, und Daniel Miller Stuhl in Otologie und Heilkunde an der Harvard Medical School in Boston . "Jetzt, da wir wissen, dass beide HPV -Status und intra- Tumor- Heterogenität Sache Patienten Ergebnis , in einer besseren Position , die Therapie für unsere Patienten zu personifizieren sind wir . Wir können weniger toxische Therapien bei Patienten wahrscheinlich geheilt werden versuchen , und versuchen, neue oder alternative Therapien bei Patienten wahrscheinlich scheitern . Zusätzlich kann es dazu beitragen, die Patienten am ehesten von klinischen Studien profitieren. "