" Rational Drug Design " Identifiziert Fragments Of FDA zugelassene Medikamente zu führenden Viren
Wenn neue Viren wie H5N1 ( Vogelgrippe - Eine massive , Daten - Knirschen Computersuchprogramm, die Fragmente von potenziellen Wirkstoffmoleküle zu den bekannten Formen der viralen Oberflächenproteine übereinstimmt hat mehrere von der FDA zugelassene Medikamente, die die Grundlage für neue Medikamente sein könnte identifiziert Grippe ) Oder H1N1 / 09 ( Schweinegrippe ) Entwickeln Resistenz gegen aktuelle Antivirentherapien - nach einer Präsentation auf der American Society for Cell Biology ( AS-Zentralbank ) 49. Jahrestagung , 5-9 Dezember 2009 in San Diego .
Die Verbindungen wurden durch eine " rational drug design " Projekt im Labor von Andrew McCammon , Ph.D., HHMI Ermittler an der University of California in San Diego identifiziert.
Die McCammon Labor geschliffen die Suchalgorithmen , die Identifizierung der zweiten Generation von Anti -HIV-Medikamente geholfen.
Wie passend einen Schlüssel für ein Schloss , Computersuchalgorithmenzu nehmen , die bekannten Formen von Drogen und passen sie , einer nach dem anderen , zu den bekannten Formen der Krankheit im Zusammenhang mit Proteinen.
In der Studie an der AS-Zentralbank Konferenz vorgestellt , Daniel B. Dadon , ein Mitglied der McCammon Labor , wird erklärt, wie die Suche gezielt die Neuraminidase- Proteine , eine der beiden großen Gruppen von Glykoproteinen auf der Außenfläche Grippe Viren.
Da Biomoleküle nicht still sitzen - sie sind bewegliche Ziele - Wissenschaftler müssen überlegen, wie das Protein geringfügig verschieben Position oder Form . Dadon sagte: " Ein einzelnes Bild eines schlafenden Geparden zum Beispiel könnte darauf hindeuten , dass das Tier immer lethargisch. In Wirklichkeit ist ein Gepard dynamischen und verbrachte einen Großteil seiner Zeit im Sitzen , Laufen, Klettern , anzugreifen und zu Fuß . "
Die erfolgreiche Erfassung von Geparden oder Influenzaviren erfordert ein Verständnis ihrer Bewegungen im Laufe der Zeit .
Ein Suchalgorithmus , der für die Flexibilität der molekularen Andockstellen Konten ist das Herzstück von der McCammon Gruppe entspannt komplexes System (RCS) .
Nach dem Studium der Neuraminidase Flexibilität konnten die Forscher eine virtuelle Bibliothek von arzneistoffähnlichen Molekülen, die durch Mischen und Anpassen von Teilen der verschiedenen von der FDA zugelassene Medikamente.
Die von den RCS -Simulationen gewonnenen Informationen wurde verwendet, um Moleküle in dieser neuen Bibliothek, die Neuraminidase -Funktion am besten verhindern würde zu identifizieren.
Sechs Verbindungen wurden vorhergesagt Neuraminidase besser hemmen als FDA-zugelassene Medikamente wie Oseltamivir und Zanamivir peramivir .
Die Computerdaten zeigt auch, dass einige dieser Verbindungen können andere Teile des Neuraminidase- Protein zielen. Die Fähigkeit, diese zusätzlichen Teile der Neuraminidase- Protein zielen könnte sich als nützlich erweisen , wenn die neuen Viren entwickeln Resistenz gegen aktuelle Therapien.
Daniel B. Dadon präsentiert " das rationale Design von Prognostizierte Neuraminidase -Inhibitoren für die Behandlung von Schweine- und Vogelgrippe ", am Sonntag, den 6. Dezember 12: 30-2 : 30 Uhr , Poster Session 1 , neuen und aufkommenden Technologien für Zellbiologie I, Programm 771 Vorstands B718 , Ausstellungshallen DH .
Quelle: Cathy Yarbrough
American Society for Cell Biology