Castor Bean Genome Herausgegeben von Research Team darunter Wissenschaftler des Venter Institute
Ein Forscherteam Co-Leitung von Wissenschaftlern des J. Craig Venter Institute ( JCVI ) und dem Institut für Genome Sciences (IGS) , University of Maryland School of Medicine, veröffentlicht die Reihenfolge und die Analyse des Rizinus ( Ricinus communis ) Genom Nature Biotechnology. Agnes P. Chan , Ph.D., JCVI und Jonathan Crabtree , Ph.D., waren IGS Co-Lead- Autoren auf dem Papier den 4.5X Berichterstattung über dieses wichtige Ölsaat beschreiben . Die Verfügbarkeit des Rizinus Genom hat auch wichtige Biodefense Auswirkungen , da die Anlage produziert die leistungsfähige Toxin , Ricin .
Der Rizinus , eine tropische mehrjähriger Strauch in Afrika und anderen tropischen und subtropischen Regionen der Welt zu finden , ist ein Mitglied der Familie Euphorbiaceae . Es gibt etwa 6300 Arten in dieser Familie , die Maniok, Gummibaum, Zierweihnachtssterne und Jatropha enthält . Während die Rizinus -Genom ist die erste, sequenziert und aus dieser Familie veröffentlicht hat die Jatropha- Genom durch JCVI sequenziert und das Unternehmen Synthetic Genomics Inc. Jatropha ist auch ein Ölpflanze .
Die Sequenzierung des Rizinus Genoms bis 4,5 X Abdeckung wurde bei JCVI geführt . Die Ergebnisse dieser Arbeit zeigen, dass das Genom 350 Mb und hat schätzungsweise 31.237 Gene. Wegen der möglichen Verwendung von Rizinus als Biokraftstoff und seine Produktion des wirksames Gift Ricin, das Team konzentrierte Anstrengungen auf Gene zu Öl und Ricin Produktion. Sie analysierten wichtige Stoffwechselwege und Regulatorgene für die Herstellung und Lagerung von Ölen in der Rizinus beteiligt. Die Analysen könnten wichtig für Vergleichsstudien mit anderen Ölpflanzen sein und könnte auch für die gentechnische Veränderung von Rizinussamen zu Öl ohne Ricin produzieren kann.
Die Identifizierung und das Verständnis der Ricin Herstellung Genfamilie in Rizinus wird bei der Prävention und Umgang mit potenziellen Bioterrorismus Ereignisse von Bedeutung sein. Genomik ermöglicht erweiterte Diagnose- und forensischen Methoden zum Nachweis von Ricin und genaue Identifizierung der Stämme und geographischer Herkunft . Das Team entdeckte , dass die Ricin -Gen-Familie größer ist , als bisher angenommen wurde , und sie offenbart etwa 28 Gene in der Ricin Herstellung Familie. In einem nächsten Schritt , schlagen die Gruppe weitere vergleichende genomische Studien mit dem nahen Angehörigen Maniok, eine große Ernte in den Entwicklungsländern , um ihre Krankheitsresistenz Aspekte weiter aufzuklären .
Dr. Chan sagte: " Die Verfügbarkeit des Rizinus Genom mehr Forschung über die positiven Aspekte dieser Ölsaat als potenzieller Biokraftstoffe zu fördern. Weitere Studien werden auch viele Aspekte aufzuklären über Ricin und ermöglichen es Forschern, die Beseitigung potenziell die Gefahr des Bioterrorismus davon natürlichen Toxin. "
Andere Organisationen in der Forschung beteiligt waren : Zentrum für Bioinformatik und Computational Biology , University of Maryland , College Park, MD ; United States Department of Agriculture , Agricultural Research Service , Western Regional Research Center, Crop Improvement and Utilization, Albany , CA; Center for Plant Science Innovation und Department of Biochemistry , University of Nebraska- Lincoln, Lincoln, NE ; International Institute of Tropical Agriculture , Oyo Zustand , Ibadan , Nigeria ; Institut für Mikrobiologie und Genetik , Abteilung Bioinformatik , Universität Göttingen, Göttingen, Deutschland ; die Grundzüge der Institute des Massachusetts Institute of Technology und Harvard, Cambridge, MA ; und der Abteilung für Biochemie und Molekularbiologie , Universität von Maryland School of Medicine, Baltimore, MD .
Diese Forschung wurde durch einen Vertrag aus dem Nationalen Institut für Allergien und Infektionskrankheiten (NIAID ) , National Institutes of Health , Department of Health and Human Services finanziert ; ein FBI Finanzhilfe; und ein National Science Foundation Zuschuss DBI 0701919 EBC .
Quelle: J. Craig Venter Institute