GenoTHREAT Bildschirme für Biosicherheit Risiken

Ein Softwarepaket entwickelt, um die potenziellen Risiken der Synthetischen Biologie für die Nation der Verteidigung und Sicherheit zu minimieren, ist in einer Open-Source -Format nun auch für die Gensynthese Industrie und der synthetischen Biologie Gemeinschaft.

Virginia Tech hat GenoTHREAT , ein Software-Tool, erkennt die Verwendung von synthetischen DNA als Bioterrorismus Agenten hilft lizenziert. Entwickelt als Open Source-Projekt von einem Team um Jean Peccoud , Associate Professor an der Virginia Bioinformatics Institute an der Virginia Tech führte , wird sie mit Hilfe der Apache License Version 2.0 , um breite Zugänglichkeit zu gewährleisten freigegeben.

GenoTHREAT implementiert die " beste Übereinstimmung " Screening-Protokoll -Methode von der Bundesregierung empfohlen, um das Risiko, dass nicht autorisierte Personen oder Personen mit böswilligen Absichten werden Giftstoffe und andere potentiell gefährliche Materialien aus DNA-Synthese -Anbieter erhalten minimieren. Der Prozess der Entwicklung GenoTHREAT erlaubt Peccoud -Team zu einer strengen bioinformatische Analyse der Stärken und Schwächen der besten Match-Methode , die in der März-Ausgabe der veröffentlichten führen Nature Biotechnology.

" Es war natürlich, zu entwickeln beginnen GenoTHREAT rund um die Bundes Leitlinien für synthetische DNA ", sagte Peccoud . " Da die Verordnung nur eine von vielen Vorschriften und Richtlinien, die Anbieter von synthetischen DNA erfüllen müssen , zielen unsere aktuellen Bemühungen um die Entwicklung einer umfassen Biosicherheit Lösung, die für eine Vielzahl von Benutzern angepasst werden können . "

Fünf der Co- Autoren des Berichts - Arunima Srivastava von Delhi, Indien , im zweiten Jahr im Hauptfach Informatik in der College of Science ; Michael Kozar von Harwich , Massachusetts , eine Junior- Hauptfach Biologie in der Hochschule für Wissenschaft und Französisch in der College of Liberal Arts und Humanwissenschaften . Tyler Stewart von Springfield , Va, eine Junior mit Schwerpunkt in den biologischen Wissenschaften in der Hochschule für Wissenschaft und Biochemie in der Hochschule für Landwirtschaft und Lebenswissenschaften . und Gaelle Letort und Olivier Mirat , Gaststudenten aus ENSIMAG , einer Ingenieurschule in Grenoble, Frankreich - sind Studenten , die mit Peccoud gearbeitet und waren Teil einer Gruppe von Studenten in der 2010 Internationale Genetically Engineered Machines ( iGEM ) Wettbewerb eingeschrieben . Die beiden anderen Autoren sind Laura Adam , Wissenschaftlicher Mitarbeiter und Mandy Wilson, Datenbankadministrator mit Peccoud Gruppe

"Dieses Projekt zeigt, wie es möglich ist, die Schüler interdisziplinären Strategien verwenden, um die heutigen wichtigsten wissenschaftlichen Probleme zu konfrontieren zu trainieren ", sagte Virginia Tech -Vizepräsident und Dekan für Undergraduate Education Daniel Wubah . "Durch den Abbau der Trennung von Grundlagen- und angewandter Forschung , und durch die Kombination von Engineering und Life-Science- Know-how hat dieses Team einen wertvollen Beitrag zu einem realen Problem direkt an die Sicherheit unserer Nation verwandt werden. "

Seit der ersten synthetischen Zelle im Mai 2010 haben die Sicherheit und ethische Aspekte der synthetischen Biologie in Anhörungen im Kongress und von der präsidialen Kommission für das Studium der bioethischen Fragen und der Nationalen Akademie der Wissenschaften , unter anderem diskutiert.

"Während die US-Regierung keine besonderen Werkzeuge unterstützen , wie in der Anleitung angegeben ist, ist die US-Regierung unterstützt Bemühungen, neue und verbesserte Verfahren zu entwickeln, um doppelsträngige DNA- Sequenzen, die für die biologische Sicherheit Zwecke zu screenen ", erklärte Capt . Theresa Lawrence von der US Department of Health and Human Services . "Wir begrüßen die Bemühungen , diesen wichtigen Bereich der Wissenschaft voranzubringen und die Sicherheit zu erhöhen . "

Quelle:
Susan Trulove
Virginia Tech