NCGR Software ermöglicht die Identifizierung von mutierten Genen eindeutig zuzuordnen Mesotheliom Tumoren

Das Nationale Zentrum für Genom Resources ( NCGR ) kündigte die Einführung des ersten webbasierten Softwaresystem , das speziell für die Analyse von ultra- Hochdurchsatz- DNA-Sequenzierung Projekte . Die neue Software -System , AlpheusTM , ermöglichen es den Forschern sehr wissenschaftlich aussagekräftigen Ergebnissen von massiven DNA-Sequenzierung Projekte zu erreichen . Forscher von Brigham and Womens Hospital ( BWH ) gab heute bekannt , dass sie AlpheusTM beschäftigt hatte, die einzigartige genetische Mutationen von Krebstumoren bei einzelnen Patienten zu entdecken. Dieser neue Ansatz kann erheblich verbessern therapeutische Entscheidungen für Krebspatienten.

BWH Forscher verwendeten AlpheusTM um die DNA- Sequenzen aller in Tumoren exprimierten Genen von vier Patienten mit analysieren Mesotheliom , Ein Asbest verursacht Lungenkrebs . Etwa 266 Millionen Basen der exprimierten Gene wurden pro Patient gemeinsam mit 454 Life Sciences , Inc. sequenziert und mit AlpheusTM Software analysiert. AlpheusTM wurde gemeinsam mit BWH Forscher Pipeline ultra- Hochdurchsatz- DNA-Sequenzen entwickelt , so dass Vergleiche zwischen Patienten und mit Referenzdatenbanken , um Kandidaten -Mutationen , die von unabhängigen Methoden validiert wurden identifiziert . In den vier Mesotheliom Tumoren 15 neue Mutationen mehrerer Arten entdeckt und jedes Mesotheliom Tumor hatte eine einzigartige Mutation Profil. Keine der mutierten Gene je in Mesotheliom gebracht. Jeder Tumor hatte eine einzigartige Mutation Profil , ähnlich wie mit einem eindeutigen Fingerabdruck. Die Forschungsergebnisse werden in der 25. Februar 2008 Ausgabe der veröffentlichten Proceedings of the National Academy of Sciences .

Die Ergebnisse zeigen die Nützlichkeit der AlpheusTM System patientenspezifische Mutationen in massive Anzahl von DNA-Sequenzen aus Tumorgewebe zu erkennen und deuten darauf hin , dass dieser Ansatz ein neuer Standard für die Entdeckung von Mutationen, die Krebs zu Grunde liegen werden . Dieser Ansatz weist den Weg zur individualisierten Analyse von Patiententumorenfördert somit die Entdeckungen, die ein enormes Potenzial , um individuelle Patientenversorgung zu verbessern und führen Therapie .

" Eine wirklich erfreuliche Aspekt unserer Ergebnisse ist , nachdem er ein Jahr und eine Hälfte , die Methodik und Software für die Pipeline zu entwickeln , können neue Tumoren im Laufe der etwa einen Monat lang analysiert werden ", sagte David Sugarbaker , Leiter der Abteilung für Thoraxchirurgie bei BWH , Blei -Autor der Studie . " Zu wissen, welche Gene mutiert sind öffnet die Tür zum Verständnis und die Entdeckung von mehr zielgerichtete und effektive Patienten-spezifischen Behandlungen in Echtzeit zu verbessern. "

Die Forschung wurde von der Internationalen Mesotheliom -Programm an BWH ( http://www.impmeso.org ) unterstützt. Alle Daten werden zum Zeitpunkt der Veröffentlichung der Öffentlichkeit zugänglich gemacht werden.

BWHist eine 747 - Bett gemeinnützige Tochtergesellschaft der Lehre der Harvard Medical School und ein Gründungsmitglied des Partners Healthcare , eine integrierte Gesundheitsversorgung Netzwerk. Für weitere Informationen über BWH , besuchen Sie bitte www.brighamandwomens.org .

NCGRist eine gemeinnützige 501 (c) 3 Organisation, deren Ziel ist es, die Gesundheit zu verbessern , Ernährung und die Umwelt durch Genom -Sequenzierung und Analyse . Um mehr über NCGR zu erfahren, besuchen http://www.ncgr.org .