Den Ausbruch von Krankheiten zu bekämpfen, die öffentliche Gesundheit Beamten oft mühsame Feldarbeit , zu versuchen, einen Schritt voraus zu der infektiösen Bugs bleiben , verbindet die Symptome der Patienten zu einer Quelle der Infektion , die häufigste Ursache schnell erkennen in ähnlichen Fällen .
Nun , ein neues Feld namens genomische Epidemiologie ist die Nutzung der schnell reduziert Kosten der nächsten Generation von DNA-Sequenzierung , um besser zu informieren Beamte des öffentlichen Gesundheitswesens mit laufenden Ausbrüchen konfrontiert . In der erweiterten Online-Ausgabe der Molekularbiologie und Evolution, Autoren Didelot et al. entwickelt eine vielseitige Rechenwerkzeug , das an Genomdaten alleine verlassen können oder angepasst werden, um gewichtete Daten aus Feldepidemiologie(zB Zeitpunkt der Infektiosität , Niveau der Infektiosität , geographische Lage , etc.) hinzufügen. Die Forschungsgruppe untersucht die Zuverlässigkeit des neuen Werkzeugs gegen einen realen Datensatzes , um die Übertragung eines Ausbruchs von M. rekonstruieren Tuberkulose .
. "Wir sind am Rande einer spannenden neuen Ära in der öffentlichen Gesundheit Epidemiologie, wie Genomik gibt uns die Möglichkeit, Ausbrüche in weit genauer und wesentlich genauer als je zuvor zu rekonstruieren Dieses Papier befasst sich eine wichtige Frage - wie viel Informationen zu einem Ausbruch können wir sicher von genomischen Daten stammen allein - und gibt die öffentliche Gesundheit Beamten ein neues Werkzeug für ihre Detektiv -Kits ", so Jennifer Autoren Gardy , Caroline Colijn und Xavier Didelot .
Mit ihren Werkzeug fanden sie, dass sie in der Lage , verschiedene Aspekte des bekannt Epidemiologie zu erfassen waren . Zum Beispiel die Methode richtig gefolgert die wahrscheinlichste Quelle Fall und mehrere Schlüsselübertragung Clustern.
Während die Autoren warnen, dass die Genomik allein nicht wirklich traditionelle Epidemiologie ersetzen , zeigen sie den Wert und das Potenzial der Verwendung ihrer Sequenzdaten -Analyse-Tool als Begleiter Verfahren für Beamte des öffentlichen Gesundheitswesens , um Licht auf Ausbrüchen zu vergießen.