Eine Studie, die Wissenschaftler Xavier Salvatella und Modesto Orozco am IRB Barcelona heraus, dass die Datenautobahnen und eine Verbindung zu korrelieren entfernten Stellen innerhalb eines einzigen Proteins .
Veröffentlicht in Nature Communications , der Artikel fördert eine Schlüssel theoretischen Bereich für die Wirkstoffforschung , da sie die Entdeckung vieler weiterer Arzneimittelbindungsstellen in Proteinen der biomedizinischen Interesse ermöglichen.
Proteine sind Ketten von Aminosäuren, die , wenn sie in bestimmten Strukturmuster gefaltet und auch im ausgeklappten Zustand , üben Funktionen innerhalb der Zellen . Proteine Empfangssignale , die von einem zum nächsten übertragen werden , und dass für das Leben wesentlich sind . Doch innerhalb eines bestimmten Proteins , gibt es " Autobahnen " , entlang der die Signale übertragen werden , wie ein in einer Staffel ? Das heißt , wie ist die in einem bestimmten Protein übertragenen Informationen ? "Dies ist eine der wichtigsten Fragen in der Biophysik ", sagt Xavier Salvatella , ICREA Professor am Institut für Forschung in der Biomedizin (IRB Barcelona) und Leiter des Molecular Biophysics Lab.
Die jüngste Studie in diesem Bereich in Nature Communications veröffentlicht in Zusammenarbeit mit Modesto Orozco , ein Experte in bioinformatische Simulationen der auch bei IRB Barcelona, zeigt, dass die Übertragung von Informationen über weite Strecken in Proteinen vorkommt. Diese Übertragung wurde beobachtet, und für alle Proteine mit Beta Blättern, eine der beiden Strukturmuster, die für Proteine annehmen gefaltet gezeigt .
"Wir entdecken die Informationsübertragungswegeim Inneren von Proteinen und diesem Konzept, das wir für eine Art von Protein- Strukturmotiv validiert haben , können wir spekulieren, dass Proteine haben viele gültige Oberflächen, auf denen ein Medikament wirken kann ", erzählt Salvatella .
Die Wissenschaftler haben entdeckt, wie die Bewegungen der verschiedenen Teile von Proteinen , obwohl physikalisch weit auseinander, korreliert sind. " Das gleiche passiert , um Proteine wie es um die Choreographie der Balletttänzer , wo die Bewegungen der Teilnehmer trotz körperlich voneinander miteinander verbunden sind . Wenn die erste, hebt den Arm , hebt der letzte, den Arm zu ", beschreibt die Forscher.
Eine Goldgrube für die Wirkstoffforschung
Medikamente wirken auf einen bestimmten Ort oder aktive Domäne eines Zielproteins in einer gegebenen Krankheit. In den meisten Infektionskrankheiten und Krebs, ist eines der Probleme, die der Seite, wo das Medikament in Wechselwirkung entwickelt und mutiert und das Medikament wird ineffizient gemacht . Das Konzept , die jetzt von IRB Barcelona Forscher bestätigt , erlaubt es, zu glauben, dass der Ort, wo das Medikament geleitet wurde ist ebenso gültig wie jede andere Punkt entlang der Übertragungsstrecke .
"Wenn das dieser Fall - das ist, was unsere Daten zeigen, - . Wir in der Lage, viele Seiten innerhalb der Struktur eines Proteins, das genauso oder noch effizienter bei der Interaktion mit einem Medikament fände Seiten , dass zwar weit von der Taste liegend oder Funktionsstelle des Proteins , die gleiche Wirkung haben würde ", argumentiert Salvatella .
Der Wissenschaftler erklärt weiter , dass es bereits viele Medikamente , die auf Websites, die nicht die Wirkstoffe Seiten sind zu handeln , sondern dass diese Medikamente wurden von serendipity entdeckt, durch massive Screenings von Molekülen und Feststellung, dass sie zu einer unerwarteten Stelle gebunden . "Dieses System ist eindeutig nicht effizient. Wir müssen in der Lage, es zu organisieren und wenn wir es schaffen , dies zu tun , dann werden wir eine starke Möglichkeit, um neue Medikamente zu entdecken ", erklärt der Forscher .
Neben der Förderung der Begriffsfeld wird Salvatella mit Proteinen der biomedizinischen Interesse arbeiten . "Wir wissen bereits genug, um parallel die Wege von Proteinen der biomedizinischen Interesse zu studieren. Wenn wir erfolgreich sind , werden wir eine Goldmine für die Wirkstoffforschung entdeckt haben ", bestätigt der Wissenschaftler.