Whole Genome Sequencing von mehrere Patienten mit Bauchspeicheldrüsenkrebs

Sequenzierung ganzer Genome - Buchstabieren Alle 3 Milliarden Buchstaben im menschlichen Genom - " ist eine offensichtliche und leistungsfähige Methode zur Erweiterung der Kenntnisse über Bauchspeicheldrüsenkrebs, " nach einer neuen Studie von TGen , Mayo Clinic und Scottsdale Healthcare .

Das Translational Genomics Research Institute ( TGen ) zeigten, dass der Einsatz von WGS "steht für eine überzeugende Lösung zu erhalten detaillierte molekulare Informationen über Tumor Biopsien , um Leitlinien für die therapeutische Auswahl bieten ", schloss der in der Zeitschrift veröffentlichten Studie PLoS ONE .

Untersuchen drei Patienten die Studie geschriebene die DNA von normalen Zellen verglichen , die auf die DNA von Zellen aus Biopsien von Pankreas- Adenokarzinom ( PAC) , die bis zu 95 Prozent aller Pankreastumorenermöglicht . Bauchspeicheldrüsenkrebs ist die vierthäufigste Ursache für Krebstod in den USA

Mit der nächsten Generation Sequenzierung, die Studie erzeugt durchschnittlich 132 Milliarden mappable Basen oder Datenpunkte , für jeden Patienten , was zur Identifikation von 142 zellulären genetischen Codierung Ereignisse, einschließlich Mutationen , Insertionen und Deletionen , chromosomale und Kopienzahl -Varianten.

"Diese Studie ist die erste Sequenzierung ganzer Genome Erkenntnisse gepaart Tumor berichten / normale Proben von (drei) getrennte PAC Patienten gesammelt ", so der Bericht, der auch in Zusammenarbeit mit der Mayo Clinic in Arizona, der Arizona State University zusammengestellt und die Virginia G. Piper Cancer Center Clinical Trials bei Scottsdale Healthcare , die eine Partnerschaft zwischen TGen und Scottsdale Healthcare ist .

In allen drei Fallstudien, fand der Bericht mehrere potenzielle therapeutische Ziele , Hervorhebung der Notwendigkeit, das gesamte Spektrum des Genoms zu untersuchen und neu betont die Notwendigkeit, mehrere Wege von Therapeutika zu entwickeln , um die spezifischen medizinischen Herausforderungen des Patienten entsprechen.

"Krebs , und zwar hier Bauchspeicheldrüsenkrebs, ist eine sehr komplexe Erkrankung , die letztlich in eine Vielzahl von Behandlungsmethoden benötigen, um zu kontrollieren, und letztlich zu heilen ", sagte Dr. Daniel von Hoff, TGen Arzt -in-Chief , und Chief Scientific Officer für die Virginia G. Piper Cancer Center in Scottsdale Healthcare .

"Diese Studie zeigt , dass , während wir weiter , um mehr Informationen durch Sequenzierung der ganzen Genomen der Patienten zu generieren , werden wir auch weiterhin zu entdecken - mit immer mehr Selbstvertrauen - die spezifischen Mechanismen, die diesen Krebs verursachen ", so Dr. von Hoff , einer der Senior- Autor der Studie und einer der weltweit führenden Autoritäten auf Bauchspeicheldrüsenkrebs.

" Wir freuen uns sehr über die Zusammenarbeit mit TGen zu bringen Hoffnung und Stand der Technik Therapie für unsere Patienten an der Mayo Clinic Comprehensive Cancer Center ", sagte Keith Stewart , MB, Forschungsdekan an der Mayo Clinic in Arizona, und die Studie andere leitende Autor .

Im Fall von Patient 1 , beispielsweise Gene zuvor mit PAC Verbindung gebracht wurden, einschließlich BRCA2 , TP53 , CDKN2A , MYC , SMAD4 und K-ras . Aber die Studie auch neue Entdeckungen gemacht . "Obwohl BRCA2 Mutationen in PAC identifiziert worden ist, die Löschung identifizieren wir hier in Exon 10 des BRCA2 wurde bisher nicht berichtet worden ist, " in der Studie .

Mehrere Therapeutika auf der Grundlage dieser Erkenntnisse wurden angewandt, um Patienten ein , die zunächst " zeigten eine komplette Remission , '' aber entwickelte Medikamentenresistenz nach sechs Monaten.

" Der BRCA2 Löschung wahrscheinlich die treibende Mutation in dieser Patienten wie der Verlust der DNA-Reparatur -Funktionen ermöglicht das Auftreten von Mutationen ", so die Studie . "Diese Feststellung und Vereinigungs belegt die Nützlichkeit der Durchführung des gesamten Genoms Analyse von Patienten , um weniger häufig Mutationen, die für therapeutische Auswahl relevant sein könnten . "

WGS für Patient 2 und Patient 3 auch mehrere potentielle therapeutische Targets aufgedeckt durch die Identifizierung von Mutationen und Copy- Nummer ändert. Außerdem RNA-Sequenzierung oder ganze Transkriptom -Analyse, der Patient 2 und Patient 3 zeigte Genexpressionsdaten , die weitere Informationen über wahrscheinlich betroffen biologische Prozesse zur Verfügung gestellt.

Zellulären Weg Analyse aller Sequenzierungsdaten wurde ebenfalls durchgeführt , um Prozesse, die am stärksten von zellulären und Genexpression Veränderungen betroffen sein könnten .

"Da wir für die Patienten zu sequenzieren , werden wir ein besseres Verständnis des Kompendiums von Ereignissen, die eine Rolle bei der Krankheit zu erwerben , und unsere Wissensbasis für die Identifizierung und Entwicklung verbesserter Therapeutika ", sagte Winnie Liang, Ph.D., Direktor des TGen Collaborative Sequencing Center und einer der Co-Lead- Autoren der Studie .

"Diese Studie hat gezeigt, die Machbarkeit der Anwendung der Genomsequenzierung nähert gegen eventuelle Personalisierung und Präzision der Therapie für Patienten mit Bauchspeicheldrüsenkrebs ", sagte Dr. Mitesh Borad , Hämatologe / Onkologe an der Mayo Clinic in Arizona und Co-Autor der Studie. " Aktuelle Studien konzentrieren sich auf die Anwendung dieses Ansatzes in der Klinik in einem Echtzeit- Mode. "

Co-Autor Dr. Michael Demeure , klinischer Professor für TGen Rare Cancer Unit und Wissenschaftlicher Direktor des endokrinen und Seltene Tumoren Programm an der Virginia G. Piper Cancer Center in Scottsdale Healthcare , sagte: " Whole Genom-Sequenzierung bietet uns die genetischen Bauplan und Kenntnisse , die erforderlich ist , die komplexen Geheimnisse rund um Bauchspeicheldrüsenkrebs zu knacken. für seltene Krebserkrankungen , wo die Daten -Pool ist relativ klein, ist das Potenzial für Fortschritte besonders ermutigend. "

Der Nationalen Stiftung für Krebsforschung, das Randy Pausch Scholarship Fund und der Seena Magowitz Foundation : Diese bahnbrechende Studie - - Genomweite Charakterisierung von Patienten mit Adenokarzinom des Pankreas Next Generation Sequencing wurde gefördert . Zusätzliche Unterstützung wurde von der Mayo Clinic Comprehensive Cancer Center , das US Department of Health and Human Services , und Supercomputing -Ressourcen durch die National Institutes of Health zur Verfügung gestellt.

"Diese Studie ist ein wichtiger Schritt nach vorn bei der Suche nach einem Heilmittel für diese Krebsart , die das Leben meiner Mutter, Seena nahm zu finden. Wir arbeiten härter als je zuvor mit TGen und andere , diesen Kampf fortzusetzen ", sagte Roger Magowitz , Präsident und Mitbegründer des Seena Magowitz Foundation.

"Whole Genom-Sequenzierung ist ein neuer Ansatz zur Suche nach besseren Behandlungen und machen diese Behandlungen für Krebspatienten , die sie jetzt brauchen. Wir können nicht genug betonen die Notwendigkeit für diese Art der Forschung", sagte Franklin C. Salisbury Jr., Präsident der NFCR .