Erste Wiederkehrende Gene Fusion Identifizierte bei Eierstockkrebs

Forscher, Eierstockkrebs haben entdeckt, dass eine wesentliche Fraktion des Eierstocktumoren , ein Gen, die eng mit der Östrogen Rezeptor wird gebrochen und zu einem benachbarten Gens durch ein Chromosom Umlagerung kondensiert ist; ein Befund, der Licht auf, wie diese tödliche Tumoren zu entwickeln und zu verbreiten vergießen könnte . Identifizierung einer Genfusion bei Eierstockkrebs können vorsehen, Wissenschaftler mit einer neuen Möglichkeit, spezifisch identifizieren Eierstock-Krebs früh in ihrer Entwicklung und vielleicht zu neuen Behandlungsmethoden zu entwickeln.

Das Gen -Fusion wurde durch die Suche durch eine große Haufen von Daten von "deep sequencing" der Gene in Tumoren der Eierstöcke aktiven gefunden. "Auch wenn dies das erste Mal, dass eine Umlagerung von benachbarten Genen hat sich gezeigt, in einer Krebs wiederholt auftreten , vermuten wir, dass diese lokalen Umlagerungen können häufiger und wichtig, dass wir erkannt hatte sein ", sagte Patrick O. Brown, Senior-Autor der studieren und Howard Hughes Medical Institute Investigator . Die Studie, die in der 20. September Ausgabe des online, Open Access Zeitschrift erscheint PLoS BiologyEiner Non-Profit , um hierfür Technologien zur Früherkennung von möglicherweise tödlichen Krebserkrankungen gewidmet - , wurde von der National Cancer Institute, der Howard Hughes Medical Institute und der Kanarischen Stiftung.

Serösen Eierstockkrebs, die häufigste Form von Eierstockkrebs ist eine besonders tödliche Krebs, weil es in der Regel nur in einem späten Stadium in ihr Fortschreiten festgestellt , nachdem der Krebs auf andere Gewebe ausbreiten . Das Stanford- Team von Julia Salzman , Robert J. Marinelli , Peter Wang und Brown identifiziert eine wiederkehrende Genfusion zwischen ESRRA , eines Gens an den Östrogenrezeptor bezogenen und einem nahe gelegenen Gen namens C11orf20 , in etwa 15% des seröse Ovarialkarzinom Fällen getestet. Diese sehr spezifische genetische Veränderung könnte ein Marker für die Erkennung von einigen Krebsarten in einem heilbaren Stadium zu schaffen. Die Tatsache, dass Tumoren der Eierstöcke bei vielen Patienten die gleiche genetische Veränderung schlägt es wichtig, dass die Art, wie sie sich verhalten werden . " Weitere Studie wird zeigen, ob dies Genfusion trägt zu der Tumor aggressive Wachstum und die Ausbreitung ", sagte Brown.

Die Forschung, die zur Entdeckung wurde an der Stanford University School of Medicine durchgeführt und kombiniert eine relativ neue Technologie - "deep sequencing" - mit Werkzeugen aus der Genetik, Informatik und Statistik. Die Forscher waren gezielt nach Anzeichen dafür, dass der Tumor seine DNA neu angeordnet, so dass zwei verschiedene Gene wurden jetzt zusammen in der Tumor fusioniert. Julia Salzman erklärte: "Viele Gruppen haben gehofft, wiederkehrende Genfusionen in verschiedenen Krebsarten mit deep sequencing finden, aber es hat sich gezeigt, schwieriger als erwartet Doing das Experiment, um die Daten zu erhalten, ist nur der Anfang. - Analyse der Daten stellt große Herausforderungen. Wir verbrachten Monate Gestaltung Computer und statistischen Algorithmen zu sortieren, Signal vom Rauschen ". Dann war die Herausforderung, zu prüfen, ob die Feststellung, war mehr als ein Zufall. Mitarbeiter in der Canary Netzwerk am Fred Hutchinson Cancer Research Center in Seattle und der British Columbia Cancer Research Agency in Victoria, BC unabhängig bestätigte die Anwesenheit der Genfusion in mehreren Eierstockkrebs.

Feststellung, dass ESRRA und C11orf20 miteinander verschmolzen kann Einblick in das, was geschieht, wie Eierstockkrebs entwickeln zu geben, und gibt Forschern ein Ziel zu studieren. Es dient auch als Nachweis der Grundsatz, dass die tiefe Sequenzierung der Gene zum Ausdruck gebracht in der Krebs können wiederkehrende Genfusionen aufzudecken. Durch die Verwendung von ähnlichen Verfahren , sind weitere Studien in Prozess, der testet , ob weitere wichtige Gene in Tumoren der Eierstöcke zu finden. Die Arbeit hat auch breitere Potential : Millionen von Dollar wurden durch die NIH , Universitäten und anderen Organisationen auf deep sequencing von Tumoren ausgegeben worden. Weil ein großer Teil der resultierenden Daten öffentlich ist, kann im wesentlichen jeden neuen Methoden zu analysieren anzuwenden. Brown sagte, dass die Arbeit geht weiter: " . Wir testen unsere Algorithmen auf öffentlich verfügbaren Daten und hoffe, dass es vielleicht mehr Entdeckungen führen "

Finanzierung: Die Arbeit in POB Labor wurde von der Canary Foundation, Howard Hughes Medical Institute , und US-amerikanischen National Institutes of Health gewähren CA77097 . POB ist ein Ermittler des Howard Hughes Medical Institute . Work in CWD Labor wurde von der Pacific Ovarian Cancer Research Consortium und National Cancer Institute Verleihungsnummer P50 CA083636 unterstützt. Work in BHN Labor wurde von der British Columbia Cancer Foundation und US Department of Defense Zuschuss OC080380 unterstützt. JSN wird durch ein Stipendium von der kanadischen Institutes of Health Research . JS erhalten Teilweise bezahlt Unterstützung von National Science Foundation Zuschuss DMS - 0940077 . Die Geldgeber hatten keine Rolle in Studiendesign, Datenerhebung und -analyse , Entscheidung über die Veröffentlichung oder der Erstellung des Manuskripts .

Interessenkonflikt : Die Autoren haben erklärt, dass keine Interessenkonflikte bestehen .