Um ein Puzzle zu lösen , müssen Sie Formen, Muster und eine bestimmte Art von Ordnung zu erkennen. In der gleichen Weise , Forscher an der McGill University haben herausgefunden, dass die 3D- Form ein Leukämie Genom- Zelle hat einen Schlüssel zur Lösung der Rätsel der menschlichen Krankheiten . Die Forscher berichten darüber in der Open Access Zeitschrift Genome Biology .
McGill Professor Josée Dostie , ein Forscher in der Fakultät für Medizin in der Abteilung für Biochemie, das sich auf die Form durch die Region, die die Homeobox A ( HOXA ) Gene in menschlichen Zellen hergestellt - einem Satz von 11 Genen, die Proteine , die von großer Bedeutung sind Codierung zahlreiche Krebsarten . Dostie und Mitarbeitern entdeckt, dass die Form dieser Region des Genoms war ausgezeichnet bei Angabe des Subtyps Leukämie es kommt. Diese ersten Ergebnisse zeigen, dass 3D- Genomik könnte eine Möglichkeit zur Verbesserung der persönlichen Behandlung , obwohl die Anwendung in der Klinik ist eine lange Zeit.
"Ich bin interessiert an Verständnis der Rolle der Genom Faltung in Bezug auf die menschliche Gesundheit und Krankheit", sagt Dostie , der auch ein Forscher an der Goodman Krebsforschungszentrum . " Mein Ansatz nutzt Technologien, die erkennen, welche DNA-Stück in der Nähe ist, der ein, so dass wir zu rekonstruieren , wie das Genom in drei Dimensionen gefaltet durch Ansetzen diese Informationen zusammen , als ob es ein Rätsel waren " .
Dostie und die all- McGill Team untersuchen die Organisation ganzer Genome und der relevanten Krankheiten beim Menschen bestimmte Regionen . Die HOXA Gencluster einer dieser Regionen , die nicht ordnungsgemäß in vielen Krebsarten der Regulierung.
"Frühere Studien haben gezeigt, dass der Blick auf die Genexpression - die spezifischen Proteine, die von den Genen produziert - ist ein guter Indikator , ob die Patienten Leukämie " , sagt Prof. Dr. Mathieu Blanchette , ein Co- Autor der Studie und Assistant Professor an der McGill in der School of Computer Science . "Wir fanden heraus, dass verschiedene Arten von Leukämie-Zellen haben auch eine Unterscheidungs Chromatin Wechselwirkung . - Wie das Chromatin aus denen das Genom gefaltet "
Es ist unklar, in dem Moment , ob das Genom Form spielt eine Rolle bei der Entstehung der Krebs, oder ob der Krebs verursacht , das Genom , die Form zu ändern. Weitere Untersuchungen sind erforderlich, um festzustellen, ob Genom Form ist so gut anzeigt andere Arten von Krebs .
"Unsere Studie bestätigt ein neues Forschungsfeld : die Anwendung von 3D- Genomforschung für die Entwicklung der medizinischen Diagnostik oder Behandlungen, die für Krankheiten, bei denen aktuelle Technologien, einschließlich Genexpressionsdaten , nicht gelungen ist, die Patientenversorgung zu verbessern erkundet werden konnte ", sagt Dostie : "Während die Verwendung 3D Genomik in der Klinik ist noch in weiter Ferne , wenn man die technischen Herausforderungen für die Übersetzung der Informationen an das Bett benötigt , entdeckten wir einen neuen Ansatz für die Klassifizierung der Krankheit beim Menschen , die weiter untersucht werden müssen , wenn auch nur für das, was sie kann , wie das menschliche Genom zu offenbaren funktioniert. "