Vorhersage von Krebs Prognose

Forscher um Dr. Soheil Dadras an der Stanford University Medical Center haben eine neuartige Methode zur microRNAs von Krebsgewebe zu extrahieren entwickelt. Die diesbezüglichen Bericht von Ma et al , " Profiling und Identifizierung neuartiger miRNAs aus Formalin fixierten und in Paraffin eingebetteten Melanom und Lymphknotenproben, erscheint " in der Ausgabe vom September 2009 die Journal of Molecular Diagnostics .

Krebsgeweben von Patienten, werden oft durch ein Verfahren, das Formalin Fixierung und Paraffineinbettung morphologische Definition zur Identifikation beibehalten beinhaltet gespeichert ist; Jedoch kann dieses Verfahren verhindert häufig weitere molekulare Analyse der Gewebe wegen der mRNA -Abbau. Trotzdem diese Gewebe enthalten eine hohe Zahl von microRNAs (miRNAs ), die kurz genug sind (~ 22 Nukleotiden ) , die während der Fixierung Prozess nicht abgebaut werden .

In dieser Studie , Dr. Dadras und Kollegen optimiert ein neues Protokoll zur Extraktion von miRNAs aus Formalin fixierten und in Paraffin eingebetteten Gewebe. Mit dem neuen Verfahren identifizierten sie 17 neue und 53 bekannte miRNAs aus normaler Haut , Melanom, und Sentinel-Lymphknoten . Diese miRNAs wurden in einem 10 Jahre alten Exemplar gut erhalten. Dieses neue Protokoll wird daher für die Identifizierung von neuen miRNAs , die in Krebsgewebe und gesundem Gewebe unterscheiden kann ermöglichen , sogar von Lang konservierten Gewebes , was zu einer besseren Vorhersage der Krankheitsprognose und -behandlung Antwort.

Ma et al schlagen vor, daß ihre " Klonierungsstrategie hat den Vorteil, nicht nur die Entdeckung neuer und bekannter miRNA Sequenzidentität , sondern auch eine Abschätzung der relativen Expressionslevel . ... [ Diese Methodik kann vorsehen ] eine robuste Strategie , um eine genaue Expressionsprofil zu erhalten, Roman und / oder zuvor charakterisierten kleinen RNAs von klinisch definierten [ Formalin fixierten und in Paraffin eingebetteten ] Tumor Proben , was die Entdeckung von " oncomirs ' als Biomarker zu erleichtern . "

Ma Z, Lui WO , Feuer A, Dadras SS: Profilierung und Identifizierung neuartiger miRNAs aus Formalin fixierten und in Paraffin eingebetteten Melanomen und Lymphknotenproben. J Mol Diagn2009 420-429

Diese Arbeit wurde teilweise durch 2007 Dermatology Foundation Dermatopathology Forschungsbeihilfe und der Abteilung für Pathologie Forschungsmittel an der Stanford University Medical Center unterstützt.

Quelle:
Angela Colmone
American Journal of Pathology