Tests für Huntington Disease Optimierte By Novel -Test
Hohe Sensitivität und Spezifität reduziert Bedarf an zusätzlichen Tests, in der gemeldet Journal of Molecular Diagnostics
Ein neuer Test kann helfen, genetische Tests zur Huntington-Krankheit (HD) durch Erzeugen genaue Ergebnisse , unnötige zusätzliche Tests und die Verbesserung der Durchlaufzeiten zu optimieren. Der Test, der chimärer oder Triplet Repeat verwendet grundiert PCR ( TP PCR ) -Methode zu Ergebnissen geführt , die 100% konkordant mit Standard Genotypisierungsmethoden in einer Analyse von 246 Proben . Die hohe Sensitivität und Spezifität des Tests könnte die Zahl der falsch-negativen Ergebnissen verringern und sowohl die Diagnose und Prognose durch die genetische Anomalie charakteristisch für HD richtig Dimensionierung .
Huntington -Krankheit ( auch bekannt als Huntington -Krankheit oder Chorea Huntington ) ist eine erbliche und fortschreitende neurodegenerative Erkrankung, die in der Regel wird während Dreißigern oder Vierzigern einer Person offensichtlich. Mit der Zeit entwickeln HD Patienten verminderte Muskelkoordination , die offensichtlich ist, beim Gehen, Sprechen und Schlucken und Veränderungen in der Persönlichkeit zu unterziehen und Denkvermögen . Eine Mutation im Huntingtin -Gen führt zu einer abnormalen Anzahl von Wiederholungen einer Sequenz von drei Nukleotiden, wie CAG bekannt. Basierend auf der Anzahl der CAG -Wiederholungen kann eine Person angesehen werden normal ( 10-35 Wiederholungen) zu sein , ein geringes Risiko ( 36-39 Wiederholungen) oder mit hohem Risiko ( größer als 40 Wiederholungen) von haben oder zu entwickeln HD Symptome. Deshalb ist die genaue Bestimmung der Anzahl von CAG-Wiederholungen ist so wichtig.
In dieser Studie wurden 246 Proben, die zuvor von anderen Methoden analysiert worden waren, mit dem neuen Verfahren (TP PCR) getestet. Die Proben enthalten 14 DNA- Vergleichsproben aus den Coriell Cell Repositories , drei Proben aus dem College of American Pathologists Erhebung 2002 , und 229 Proben von Personen an ARUP Laboratories für klinische Zwecke von Standard-Technologien getestet , erklärte Studienleiter Elaine Lyon , PhD, Medical Director für Molekulare Genetik, ARUP Laboratories und seine Institut für Klinische und Experimentelle Pathologie und Abteilung für Pathologie , Universität von Utah, Salt Lake City, UT . Normalen Proben als auch solche mit einer Vielzahl von CAG -Repeats enthalten. Die Proben wurden verblindet und analysiert.
Die Ergebnisse zeigten , dass TP PCR richtigen Größe 240 der 246 Proben . Alle der 100 Proben in der normalen und niedrigen Risikogruppen wurden richtig bemessen . In den 146 Proben von denen bekannt ist, von HD ( solche mit > 39 CAG-Repeats ) beeinflusst werden , sind die Ergebnisse für 140 richtig abgestimmt sind, dass bei anderen Verfahren festgestellt , während die Zahl der CAG-Wiederholungen von ± 1 in 6 Proben unterschieden , die durch eine Differenz die Autoren in der Genauigkeit des Verfahrens bei höheren Wiederholungs Zahlen sein. Bis zu 101 CAG-Wiederholungen konnte genau mit diesem Test dimensioniert werden. Geraden Proben , die gefunden wurden anspruchs mit anderen Methoden analysiert werden könnte durch TP PCR ausschließlich und genau bewertet werden.
Ein weiterer Vorteil dieses neuen Verfahrens ist die Möglichkeit, echte homozygoten normalen Proben zu identifizieren , wodurch die weitere Prüfung . Mit anderen Methoden , wenn eine Probe homozygot für das normale Allel , zusätzliche Tests , die häufig mit Southern -Blot-Analyse angezeigt wird, wird immer noch wegen der Gefahr von falsch Negativen empfohlen. " Southern-Blot ist teuer, arbeitsintensiv und erfordert hohe Konzentrationen von DNA und können Durchlaufzeiten zu verzögern ", sagt Dr. Lyon . Bei HD wird bei Kindern vermutet , Dr. Lyon und Kollegen empfehlen jedoch , dass auch mit TP PCR offenbar homozygote Proben sollten weitere Tests zu unterziehen.
TP PCR verwendet eine Vorwärts- und Rückwärts chimären Primer aus mehreren Priming Stellen innerhalb des Trinukleotid wiederholen zu verstärken. TP PCR erzeugt eine charakteristische Leiter auf einem Fluoreszenz Elektropherogramm , das die schnelle und kostengünstige Identifizierung und Quantifizierung von expandierten Wiederholungen ermöglicht . Hauptpeaks und kleinere Peaks ( stottert ), die CAG -Wiederholungen können analysiert und sortierten automatisch über handelsübliche Software.