Eine internationale wissenschaftliche Zusammenarbeit von Baylor College of Medicine geführt hat Hinweise auf genetische Veränderungen , die an einer seltenen Form von beitragen können, offenbart Nierenkrebs , Neue Einblicke nicht nur in diesen seltenen Krebs , aber auch andere Typen .
Die Zusammenarbeit , ein Projekt von der National Institutes of Cancer Genome Atlas Initiative Health schloss die Reihenfolge der chromophobe Nierenzellkarzinom und veröffentlichte die Ergebnisse in der Zeitschrift Cancer Cell.
" Cancer Genome Atlas ist eine vom Bund finanzierte nationale Anstrengung , die bereits die Reihenfolge der vielen wichtigen Krebsarten abgeschlossen ist ( Brust-, Lungen-, Eierstock-, zum Beispiel) , aber dieses Projekt ist nun Verzweigung zu selteneren Krebsarten zu sequenzieren " sagte Dr. Chad Creighton , Associate Professor für Medizin und biostatistician in der NCI-Bezeichnung Dan Duncan Cancer Center am Baylor und der Führung und korrespondierender Autor zu dem Bericht . "Die Idee ist , dass ein besseres Verständnis dieser selteneren Krebsarten , gewinnen wir neue Erkenntnisse , die für , wie wir lernen andere Arten von Krebs sein könnte . Die Ergebnisse dieser Studie sind ein perfektes Beispiel dafür. "
Chromophobe Nierenzellkarzinom ist eine seltene Form von Nierenkrebs , mit rund 2.000 neuen Fällen pro Jahr in den Vereinigten Staaten diagnostiziert. Ein Großteil der Patienten überleben die Krankheit.
Klinische Auswirkungen
" Obwohl die meisten Patienten beruhigt sind , wenn die Pathologie der Niere Tumor kommt zurück als chromophobe , die wir alle für Patienten, die entwickelt und starb an metastasierendem Nierenkrebs chromophobe gekümmert haben ", sagte Dr. Kimryn Rathmell , Associate Professor für Hämatologie und Onkologie in der Lineberger Comprehensive Cancer Center an der University of North Carolina in Chapel Hill und ein Co- Senior- Autor der Studie . "Dieser Bericht ist unglaublich spannend für Ärzte, die für diese Patienten kümmern , weil alle Behandlungspläne haben wir zu diesem Punkt hatten über die Biologie der häufigsten Nierenkrebs Typ basiert , als ob chromophobe muss ein enger Verwandter der Krankheit zu sein. "
Das Projekt zeigt, ohne Unsicherheit, chromophobe Nierenzellkarzinom stellt eine andere Krebs Einheit, und zeigt spannende Biologie eigen zu der Krankheit , die wir hoffen in der Zukunft wird es neue Therapien , um speziell für die chromophobe Form von Nierenkrebs entwickelt werden, sagte Rathmell .
Das Team sequenziert 66 Tumorproben an der Baylor Human Genome Sequencing Center. Andere Arten von Daten wurden an diesen Proben gesammelt und mit der Sequenzierung integriert , einschließlich Genexpression und epigenetische Daten. Zusätzlich zur Sequenz bekannten Genen , wurde DNA aus den Mitochondrien und dem gesamten Genom sequenziert .
Chromosomen
Die Mehrheit (86 Prozent) der Proben wurde eine Kopie oder ein wesentlicher Teil der Chromosomen 1, 2 , 6, 10, 13 und 17. Die Verluste der Chromosomen 3 , 5, 8 , 9, 11 , 18 und 21 wurden ebenfalls bemerkt fehlende mit signifikanten Frequenzen ( 12 bis 58 Prozent).
Chromosomen sind die Verpackungen unserer DNA . Normalerweise erhält jede Person eine Kopie von jedem der 23 Chromosomen von jedem Elternteil für insgesamt 46 .
Wenn Wissenschaftler suchten nach Genen, die verändert oder fehlen, nur zwei Gene , TP53 und PTEN wurden , wurden mit einer ziemlich großen Frequenz identifiziert.
Zusätzlicher Schritt in der Analyse
Die überraschende und signifikante Feststellung kam, nachdem das Team hat einen " zusätzlichen Schritt " mit ihrer Analyse , sagte Creighton .
" Anstatt nur nach speziell auf die Exoms , analysierten wir auch das gesamte Genom , was in der Regel nicht in diesen Genomstudien getan", sagte Creighton . Die Exoms , der Teil des Genoms verwendet , um Proteine zu bilden , bildet nur 1 Prozent der gesamten Genoms , wobei die anderen 99 Prozent wird häufig in Untersuchungen ignoriert.
Mit ganzen Exoms Analyse Wissenschaftler gerade auf der Suche innerhalb der Grenzen der bekannten Gene , zu sehen, welche abgebaut werden und die Krankheit verursacht haben , erklärte er.
"Allerdings , wenn Sie außerhalb der Gene aussehen , gibt es viel mehr los ", sagte Creighton . "Zum Beispiel genregulatorischen Merkmale des Genoms kann verändert werden. "
TERT Promotorregion
Vom gesamten Genomanalyse , das Team beobachtet eine erhebliche Menge an Strukturänderungen oder Haltepunkte , die die Promotorregion eines Gens namens TERT , die für die wichtigste Einheit der Telomerase -Komplex kodiert.
Telomerase repräsentieren die "Uhr" der Zelle , sagte Creighton . "Dies spielt eine entscheidende Rolle bei der Zellteilung und bei vielen Krebszellen , sind Telomerase Ebenen sehr hoch und die Zeit nie wirklich abläuft , was die Zelle niemals sterben kann. "
Es war die Promotorregion , nicht das eigentliche Gen , dass betroffen war, geklärt Creighton . " Da gibt es nicht eine Panne in der eigentlichen Gen , diese Fehlfunktion ist nicht ganz Exoms Analyse gerichtet. "
Die Studie hat auch interessante Fragen über die Rolle der mitochondrialen DNA-Veränderungen und der Ursprungszelle in der Krebs Einleitung beteiligt hob , stellte die Autoren.
Dies könnte neue Ansätze für die , wie Wissenschaftler sollten molekulare Studien von Krebs führen bedeuten , sagte er. " Wir müssen die regulatorischen Bereiche für andere Krebsarten sowie zu überwachen. "
Die Daten aller Projekte des Cancer Genome Atlas sind für Wissenschaftler auf der ganzen Welt zur Verfügung zu studieren . " Diese Bemühungen haben einen großen Einfluss darauf, wie wir lernen Krebs als Ganzes hatte ", sagte Creighton .