Forscher von BGI , arbeiten innerhalb der Metagenomik des Projekts menschlichen Darm -Trakt ( MetaHIT ) und in Zusammenarbeit mit anderen Institutionen auf der ganzen Welt , haben die höchste Qualität integrierte Gen-Set für den menschlichen Darm microbiome um Datum- etabliert ein nahen Komplett Katalog der Mikroben, die in uns und massiv zahlreicher als unsere eigenen Zellen befinden. Während die rund 20.000 Gene im menschlichen Genom sind seit über zehn Jahren zur Verfügung , muss der Gen- Katalog der microbiome unserer viel größeren " anderen Genoms " , bis heute wurden mehr schlecht verstanden und charakterisiert.
Die aus dieser Studie veröffentlichten Daten sollten weitere Untersuchungen über die Wechselwirkungen zwischen Mensch und mikrobieller Genome zu erleichtern, und bringt uns näher an das Verständnis , wie man das mikrobielle Gleichgewicht , die uns gesund hält aufrecht zu erhalten. Die aktuelle Studie wurde online in der Zeitschrift Nature Biotechnology veröffentlicht .
Jedes unserer Mut wird von mehr als 3 Pfund Mikroorganismen besiedelt , die sich Giftstoffe , Herstellung brechen kann Vitamine und essentiellen Aminosäuren, und bilden eine Barriere gegen Eindringlinge . Bislang gab es einen Mangel an umfassenden und einheitlich verarbeitet Datenbankressourcen Katalogisierung der menschlichen Darmflora auf der ganzen Welt , die unser Wissen über die genetischen und funktionellen Mechanismus der menschlichen Darm Mikroben behindert hat .
In dieser Studie etablierten Forschern Katalog der menschlichen Darm mikrobiellen Gene durch die Verarbeitung von 249 neu sequenzierten Proben und 1018 veröffentlicht Proben aus MetaHIT , Human Microbiome Project ( HMP ) und ein großes Diabetes -Studie aus China, sowie 511 sequenzierten Genomen von gut- verwandte Bakterien und Archaeen . Diese erweiterte Forschung ist wenigstens dreimal größer als der bei den vorangegangenen Gens Katalogen Kohorten .
Basierend auf dem Katalog suchten die Forscher die Darmflora des gesunden chinesischen und Danish Erwachsene, und fanden die zwei Kohorten stark Nährstoffwechsel sowie xenobiotischen Entgiftung unterschieden , die durch die Unterschiede in der Ernährung und Umgebung beeinflusst werden könnten . Außerdem beobachteten sie in möglichst Bereicherung Antibiotikum Resistenzgene sowohl auf Bevölkerungsebene ( Penicillin-Resistenz in Dänen und Multidrug-Resistenz in Chinesisch) und in den einzelnen - spezifische Gene , die die Notwendigkeit einer engen Überwachung der direkten und indirekten Exposition gegenüber Antibiotika hervorgehoben.
Individualspezifischen Genen trugen überwiegend auf die erhöhte GesamtzahlGens in integrierten Gens Katalog und wurden in den Genen für die Synthese von Zellwandkomponenten , DNA -bezogene Funktionen wie Transposasen , Endonukleasen und DNA Methylasen Kodierungs Phagen - verwandte Proteine verantwortlich repräsentiert. Solche individuellen spezifischer Gene wahrscheinlich reflektieren Anpassung und könnte den entscheidenden Kombination von genetischen , Ernährungs-und medizinischen Faktoren in einem Wirt zu reflektieren.
Diese nicht-redundanten Referenz Katalog von über 9,8 Millionen Genen ist über die Website frei zugänglich , und die Daten wurden auch in BGI GigaScience Database, GigaDB und der SRA hinterlegt. Es bietet eine sehr erweitert und unschätzbare Ressource für globale Forscher , tiefer zu erkunden Sie die geographischen, genetische , zeitliche und physiologischen Eigenschaften der Darmmikroben.
Junhua Li, Research Scientist von BGI , sagte: " Die Kataloge des Referenzgenen im menschlichen Darm microbiome sollten quantitative Charakterisierung von Mehr schaftlichen Daten aus dem Darm microbiome erleichtern , seine Unterschiede zwischen den Bevölkerungsgruppen in die menschliche Gesundheit und Krankheit zu verstehen . "