Ergebnisse einer vergleichenden Studie der molekularen Immunantworten gegen Influenza und Pneumokokken-Impfstoffe

In einer Handschrift veröffentlicht ImmunitätWissenschaftler der Benaroya Research Institute at Virginia Mason (BRI) und dem Baylor Institut für Immunologie Forschung ( BIIR ) berichten über die Ergebnisse einer vergleichenden Studie der molekularen Immunreaktionen auf Grippe und Pneumokokken-Impfstoffe . Darüber hinaus wurde modernste Web-Technologie verwendet werden, um die Verbreitung von Daten , um das Tempo der wissenschaftlichen Forschung zu verbessern. Der Artikel enthält interaktive Zahlen * , die angepasst und ermöglichen eine dynamische Untersuchung der primären Daten von einem Web-Portal , die im Rahmen dieser Studie entwickelt wurde, und könnte als Modell für künftige wissenschaftliche Veröffentlichung und gemeinsame Nutzung von Daten dienen kann.

Die Studie, die von Karolina Pałuki , MD, PhD ( BIIR ) , Damien CHAUSSABEL , PhD (BRI) und Jacques Banchereau , PhD ( BIIR ) geführt wurde , verwendete eine Systeme Immunologie Ansatz und Hochdurchsatz- Profiling- Techniken zur Analyse der molekularen und zellulären Reaktionen nach der Impfung . Sie fanden heraus, dass die Influenza-Impfstoff führte zu Genaktivität durch Interferon induziert wird, während die Pneumokokkenimpfstoff führte zu einer Erhöhung der myeloid- und entzündungsbedingten Genaktivität , was darauf hindeutet , daß die beiden Impfstoffe hervorzurufen Immunschutz durch deutliche Immunantwort Pfade.

" Diese Verbindung von modernster menschliche Immunologie und state-of- the-Art- Data-Mining -Funktionen geht wirklich unsere Forschung auf die nächste Ebene durch die Optimierung der Suchprozess Identifizierung neuer Ansätze zur Bekämpfung von Krankheiten ", sagte Dr. Pałuki . " Durch das Verständnis der Immun Wege, durch die diese Impfstoffe arbeiten , können wir besser leiten die Entwicklung wirksamer Impfstoffe gegen andere Infektionskrankheiten . "

Systembiologie wie die, die in dieser Veröffentlichung enthaltenen erzeugen enorme Mengen an Daten mit Messungen der Zehntausende von Parametern. Oft , ein Großteil der Daten sieht wenig Untersuchungen. Um den Wert der Daten in dieser klinischen Studie zu erweitern , entwickelten die Autoren von Webanwendungen die Exploration der Daten durch den breiteren wissenschaftlichen Gemeinschaft ermöglichen. Die Artikel verlinkt direkt iFigures ! im Web-Portal , das dynamische Untersuchung der vorgelegten Zahlen und zugrunde liegenden Daten ermöglicht . Leser kann aufeinander und passen Zahlen des Artikels durch Zugabe von Variablen oder Einstellen von Parametern . Sie sind in der Lage, Feinabstimmung ihrer Sicht auf die Daten auf der Grundlage ihrer eigenen Forschungsinteressen und Know-how und untersuchen weitere Hypothesen mit dem vollständigen Datensatz .

"Unser Ziel war es, den Zugriff auf diese sehr komplexen Datensätzen einfach und angenehm für die Ermittler, die einzigartigen Kenntnisse der Immunologie und Medizin , aber die möglicherweise nicht über eine Menge von Bioinformatik oder Statistiken Erfahrung ", erklärt Dr. CHAUSSABEL . "Sie werden in der Lage, schauen ihre Lieblings- Moleküle und Einblicke , die nur sie , mit ihrem einzigartigen Wissen über diese Moleküle , erhalten könnte . "

Darüber hinaus enthält das System -Tools zu verbessern und den Austausch neuer Erkenntnisse und Einsichten. Novel Analysen gesammelt , organisiert und über E-Mail und Social Networking-Anwendungen des Web- Portals geteilt.

" Die Leichtigkeit, mit der Ergebnisse gemeinsam genutzt werden können stellt die enorme Menge an Daten, die von dieser Art von Systembiologie Studien nur ein paar Klicks entfernt von tausenden Immunologie Experten gesammelt ", sagte Gerald Nepom , MD, PhD , Direktor, BRI . " Diese Publikation und Web-Portal zu befreien die Daten, die auf neue Arten von Wissenschaftlern auf der ganzen Welt zu beschleunigen Entdeckungen erneut analysiert werden kann. "