Kodierungsvarianten in Immunkrankheit im Zusammenhang mit Genen spielen nur einen kleinen Teil der Gesamt genetischen Risiko für Psoriasis, nach einer neuen Studie von Anhui Medical University und BGI geführt. Diese Schlussfolgerung wird stark von ihrer Untersuchung über den Beitrag der funktionalen Codierung Varianten Psoriasis bei 21.309 chinesischen Einzelpersonen unterstützt. In einem solchen Groß Untersuchung nur Forscher entdeckten zwei unabhängige niederfrequente Varianten mit mäßiger Wirkung auf Krankheitsrisikos . Die aktuelle Studie wurde online veröffentlicht in Nature Genetics .
Psoriasis ist eine komplexe , chronische , lebenslange Hautkrankheit. Es fällt in der Regel zunächst die Menschen im Alter von 15 bis 35 zwischen , aber jeder kann in jedem Alter , auch Kinder betreffen. Diese schreckliche Krankheit ist das Ergebnis des Zusammenwirkens mehrerer Faktoren wie Umwelt , Genetik und Immunologie. Die schnelle und kostengünstige Sequenziertechnologien haben Forscher aktivieren, damit Sie graben zahlreiche Risiko -assoziierten Varianten der Psoriasis , aber die Funktionskodierungsvarianten, insbesondere Niederfrequenz- und seltene Varianten wurden nicht systematisch untersucht.
In dieser Studie nahmen Forscher Zweiphasen Kodierungsvarianten zu identifizieren. In der Forschungsphase , Exoms Sequenzierung auf 781 Patienten mit Psoriasis und 676 Menschen, führten sie ohne Psoriasis als Kontrolle. Die Bemühungen ergab 518.308 Single- Nukleotid- Varianten ( SNVs ) . Von diesen Varianten wurden 20,62 % synonymen und 68,13 % waren selten.
Unter Berücksichtigung der Begrenzung der Stichprobengröße und Techniken in der Entdeckungsphase , durchgeführt Forscher zwei unabhängigen Studien in einer großen Stichprobe von 9946 Patienten mit Psoriasis und 9906 Kontrollen durch gezielte Sequenzierung. Insgesamt 3,2 Mb von kodierenden DNA rund um die Zielregionen der 1326 Gene (für 133 SNVs , 622 Immunkrankheit im Zusammenhang mit Genen , und einige Top- Gene) wurde gefangen genommen . Sie 82.387 synonymen SNVs , von denen 97,07 % waren selten völlig identifiziert.
Durch die weitere Analyse , entdeckten sie zwei unabhängige Missense SNVs in IL23R und GJB2 mit niedriger Frequenz und fünf gemeinsamen Missense SNVs in LCE3D , ERAP1 , CARD14 und ZNF816A mit Psoriasis in genomweiten Bedeutung verbunden. Die seltenen Missense SNVs in FUT2 und TARBP1 wurden auch mit eindrucksvollen Beweis für die Beteiligung an dieser Krankheit beobachtet.
Neben dem SNVs Analyse Forscher untersucht 622 Immunkrankheit -Genen , und die Ergebnisse zeigten , dass die Codierungsvariantenzumindest gemeinsame und niederfrequente synonymen Varianten haben unabhängigen Beitrag zur Psoriasis Risiko. Wenn man all die Erkenntnisse zusammen , zeigte die Studie, dass synonymen SNVs in den 1326 gezielt Gene hatten begrenzten Beitrag zur Gesamt genetischen Risiko von Psoriasis.
Im Vergleich zu früheren Arbeiten zur europäischen Bevölkerung , diese Forschung zeigte auch die genetische Heterogenität zwischen europäischen und chinesischen Bevölkerung . Die Missense -Variante ( rs72474224 ) in GJB2 schien spezifisch chinesischen Individuen zu sein, während die eine ( rs11209026 ) in IL23R spezifisch europäischen Individuen war . Und eine weitere gemeinsame Missense Variante ( rs11652075 ) in CARD14 zeigte konsistente zwischen europäischen und chinesischen Proben .
Xin Jin, Co-Autor der Studie bei BGI , sagte: " Ziel- Sequenzierung in einer großen Stichprobe können wir gesamte Spektrum der Varianten in dieser Region zu untersuchen. Obwohl wir keine niederfrequenten nicht identifizieren oder seltene Codierung Varianten mit stark genetischer Effekt , der Daten hilft uns, einige bekannte GWAS Loci zu verfeinern und zu identifizieren einige Kandidaten Casual -Varianten. Es bleibt zu zeigen , ob begrenzte Beitrag der seltenen Kodierungsvarianten wird außerdem auch für andere Regionen außerhalb des Ziels und in anderen Volkskrankheiten über Psoriasis werden. "